После отмонтирования осталась туева хуча битых ссылок
При следующем "копировании" тогоже самого модуля(каталога) они (попробую угадать) восстановятся?
Если "мозолят" глаза - копировать в каталог(не в корень), а когда не нужны(модуль отключили) - внутри каталога rm -rf
Это вариант для тех прог, которые как в винде - одна прога - один каталог, а не разбросаны по всей ФС.
Или, если край конец нужно
монтировать копировать в корень( по другому не работает) - как вариант запоминать список файликов в модуле, после
отмонтирования отключения модуля - по этому списку симлинки удалять