Закинул в папку /modules
В корне iso лежит pfs-list.txt. В нем расписан порядок модулей по папкам /base и /modules в соответствии с выбранным DE.
Самое простое, полностью удалить содержимое /base и /modules и закинуть нужные модули. Потому что, похоже система грузится с первого DE LXDE-
gtk2, а требуется DE LXDE +
gtk3.
Вообще то, этим должен заниматься инсталятор, но похоже уже все на это 'положили'
и раскидывают модули вручную по папкам.