В initrd в linuxrc в строках 76 и 96 есть опции монтирования для vfat: $MOPT,umask=0,check=s,utf8
Если сделать $MOPT,umask=0,check=s,utf8,quiet - ругательства исчезают.
Пробовал дописывать еще showexec - с файлов снимается атрибут исполнимости, то есть права файлов 666, каталогов 777, исполнимыми остаются только всякие *.exe и *.com. Это уже, пожалуй, лишнее - скрипт с флешки не запустишь. А вот quiet вполне можно и применить.