Если лезешь в каталог /usr/local/apps, то:
1. Не надо ломать то, что было нормальным, а именно значек у Pup_targz исчез, у GtkHash теперь какой-то малюсенький замочек
2. У Isomaster значек ссылается на /usr/local/lib/X11/pixmaps/optical48.png, а ведь путь /usr/local/lib/X11/pixmaps уже давно не используется в PuppyRus, а уж PRA его вообще не было.
3. В каталоге playmusic нет файлов AppRun, AppInfo.xml и .DirIcon, т.е. нет соответствия приложениям, которые обычно располагаются в /usr/local/apps.
4. У каталога /usr/local/apps/Wallpaper даны права писать всем, поэтому он перестает быть приложением в ROX-е, а становится обычным каталогом.