Ни в коем разе нельзя так просто, это ведь не портабельная версия Оперы! Ее нужно нормально установить, с помощью petget (меню ПКМ). Ибо файлы кладутся не только в /root, но и в /usr/share/opera, может, и еще куда-нибудь. Потому и не работает, что там ничего не изменилось. А я не обратил внимания на интересный способ установки сразу
А переименовать (или временно удалить) файл .opera (который сам создается при запуске и хранит ваши настройки) предлагал, думая, что в нем какие-то настройки были слишком... неправильные. Вот тогда пошли бы "заводские" установки.
При нормальной установке в /root/.packages/opera_11.60.1185_i386.files можно будет посмотреть, куда и что кладется.