В Puppy пользователь - root, и может сделать с "осью" всё, что захочет. У меня Xlupurus 510 отлично выключается. Логично предположить, что к этой ситуации привели неправильные действия юзера. Если есть настроение поэкспериментировать, можете в новой "сохранёнке" повторить свои действия. Тогда вместо вопросов у вас будет ответ, что не нужно делать, что бы ось работала.