Поднастроил систему под себя решил перезагрузиться, что бы создать файл сохраненки ну просто посмотреть как она себя поведет. Файл сохраненки сохранил на разделе с нтфс, после перезагрузки иксы опять не стартовали и система файл не увидела, я на всякий случай подмонтировал диски и сделал копии файлов иксов.
Потом перезагрузился, система стартанула нормально, т.е. иксы загрузились, но файл сохраненки так и не увидела.
Да, если иксы не стартовали, то при выключении или при перезагрузке, система виснет на надписи сохранения параметров, приходиться выключаться кнопкой.