Если в системе несколько браузеров, то создается файл defaultbrowser.conf в ~/.config. Предлагаю и для остальных default* сделать подобное (ФМ, редактор, терминал и т.д.).
Мне не нравится дефолтный pcmanfm и я ставлю spacefm, а потом приходится править скрипт defaultfilemanager, меняя их местами в строке "for i in stuurman thunar pcmanfm pcmanfm-qt spacefm filestarter "defaultterminal -e mc" ;do".