Сравнение именно этих трех ФМ считаю не совсем правильным, поэтому буду приводить для сравнения и другие ФМ, а thunar убрал бы вообще из сравнения, потому что Thunar практически = XFCE.
Для мини-окружений:
rox - сделай все сам (и потом переделай еще раз, два...),
поэтому вместо него использовал бы xfe (тоже все минималистично, но в составе есть простенький текстовый редактор и просмотрщик картинок, упаковывает, распаковывает tar, compress, zip, gzip, bzip2, xz, 7zip, поиск и другое). Рабочий стол можно не рисовать, достаточно фона.
Для окружений с элементами lxde (lxsession, lxpanel, lxtask, lxterminal, lxrandr ...):
если все-таки стремиться к минимуму, то
spacefm - продвинут в плане настройки дальше некуда, но его контекстное меню мне не нравится, а каждый раз его под себя лепить - надоедает, в больших дистрах удобен возможностью распаковать файл без использования менеджера архивов и примонтирования iso,
а для золотой середины (функциональность, простота настройки и работы):
pcmanfm.
В плане работы с ftp и другими сетевыми сервисами: для thunar и pcmanfm (и множества других gtk приложений) нужен gvfs, spacefm обходится своими плагинами. gvfs - универсальное решение, поэтому на мой взгляд более выгодное.
Итого ИМХО:
pra- если уж совсем mini, то xfe, если с плюшками - то spacefm;
pra middle - openbox+lxpanel -> мой выбор pcmanfm (при наличии gvfs станет еще удобнее, и для других gtk программ полезно);
pra game - xfce, тут и вовсе без вариантов -> thunar.