Вроде починил. Задело mkpfs, pfs и pfsrebuild. Может еще чего отвалилось, но селфтест проходит.
Пробовать нужно с нуля, то есть не со старыми модулями. Теперь в названии сабмодулей расширения быть не должно. Надеюсь
З.Ы. в addlayer есть монтирование ext2/3/4, аналогично прикрутится и iso9660. То есть из этого тоже можно mkpfs'ом делать модули если убрать проверку.
Сейчас пропускает только сквоши и папки. Надо делать?
Будет типа mkpfs /dev/sda3 /dev/sr0 ./file.img ./file.iso ./dir ./module.xzm -o ofigennyi_megamodul.pfs