Архивчик Komodo-IDE-7.0.0-68957-linux-x86.tar весит чуть больше 51 Мб, насколько я понял это среда для разработки программного обеспечения, да к тому же очень и очень не дешевая (From $245 - с оф.сайта)
Если не секрет зачем вам такой монстр и за такие бабки ? Если нужен только редактор, то Komodo-Edit-7.0.0-9615-linux-x86.tar.gz бесплатный.
Зато в корневом каталоге появилась папка с полностью распакованным архивом Komodo-IDE-7.0.0-68957-linux-x86, которую нельзя удалить.
Загрузитесь с параметром pfix=ram, смонтируйте файл сохраненки и удалите там ненужную папку, потом загрузитесь как обычно и проверьте результат, ИМХО должно помочь, раз иначе не удаляется.
Точнее могу но после перезагрузки она снова появляется=(
Судя по тому, что вы упоминаете то Komodo-IDE-7.0.0-9615-linux-x86, то Komodo-IDE-7.0.0-68957-linux-x86, папка которого сама появляется, то очень похоже, что вы скачали бесплатный редактор Komodo-Edit-7.0.0-9615-linux-x86, который возможно пытается в рекламных целях предложить вам на 21 день полную платную версию. А файл Komodo-IDE-7.0.0-9615-linux-x86.tar.gz где лежит? Его надо или удалить или переместить куда-то. И еще интернет подключен постоянно и с хорошей скоростью или нет?
И почему бы просто не установить Пуппи по-новой, отформатировав раздел.
А зачем форматировать-то? Установка я так думаю, что фругал, поэтому достаточно только новую сохраненку сделать.