С помощью pfsrebuild и /etc/pfs.cfg возможно перепаковать все модули в директории с нужным сжатием?
Для этого достаточно mkpfs в цикле запустить. Указывать сжатие в /etc/pfs.cfg имеет смысл если всегда используете "недефолтное" сжатие. К примеру у меня lzo работает быстрее чем дефолтный xz и я использую его.
Вот мой.
PFSDIR=/var/lib/packages
EXT=xzm
. /usr/lib/magos/os-config
. /etc/sysconfig/MagOS
compression="$MKSQFS_OPTS"
compression_fast="$MKSQFS_FASTALG"
Сделано так, чтоб можно было задавать compression_fast и compression из MagOS.ini