попробовал через save-session, да, папка changes появляется сразу наполненная и при перезагрузки флешка мигает, что говорит что сохранение в нее сразу работает, но параметры ядра надо все равно править вручную
и еще один ньюанс, сперва я выбрал корень флешки, появилось оповещение о том что папка changes создана и надо отредактировать конфиг, но на самом деле папка не появилась, тогда я снова запустил save-session и выбрал в корне флешки папку, то в ней уже папка changes появилась наполненная