Boris, по /base совпадаем, по /modules, конечно, не совсем, но ведь это не причина для незагрузки модуля из этой папки - остальные-то все в меню видны. За исключением wine-1.7.32.pfs. Почему сразу усомнилась на тему сохранёнок как причины - на другой загрузочной флешке, где вообще не было сохранёнок, но был модуль Blender, картина была та же.