Нужно создавать мини раздел (отрезать от других разделов, ну хоть акронисом), с 3 или 4 ГБ, туда и ложить Puppy OS и там же хранить паппи save файл.
Да, ещё, читал на этом форуме, что при удалении файла Puppy Save вы теряете дисковое пространство ( винда его просто не увидит ).
Решение - просто отформатировать раздел (если было NTFS, то можно опять в нтфс ) и можно опять заливать Puppy OS и хранить save файл.