Со своей колокольни:
grub4dos - замены для флешки я не знаю (набор syslinux - хорош, но не то),
grub2 - я с 2008 года в debian (crunchbang, antiX, ubuntu, lenny, wheezy, squeeze, jessie, stretch,sid), с grub2 за это время пару раз были проблемки, которые решались в два счета, настраивать легко, размер небольшой.
NM: во многих маленьких дистрибутивах есть свои программки для настройки сети, но как только дело идет к массовому дистрибутиву - сразу появляется если не НМ так wicd: пользователи привыкли, что сеть можно настроить, ткнув мышкой в трей на значок сети, выбрать нужный пунктик, поменьше там чего-то там писать, пусть оно само там все настроит (я сам такой). А переход с одного окошка в другое, чтение предлагаемых вариантов (и что нажимать дальше?), куда потом это окошко девается? А где быстро посмотреть, когда сеть пропала и нажать кнопочку - подключить? Плюс работа с любым видом соединения, какая еще программа такого типа это обеспечит?
Нюансов много и лучше всего они разрешены именно в монстре NM.
wicd не дотягивает, хотя можно и его юзать (нет 3g).
wpa-supplicant-gui - для wifi хорош, но отображение сетей - ужас неудобное, перезапуск соединения никакой информации о том, получилось или нет, не дает (нет eth, 3g).
AutoNet - это который в middle или еще что-то другое? Если первое, то задачу первоначальной настройки сети он решает, но потом нет статуса сети и возможности быстрого выбора и перезапуска соединения. Т.е. мне не хватает значка в трее с указанной функциональностью.
И еще - самописные программы доступны именно в родных дистрибутивах, большинство разработчиков не заморачиваются на продвижение продукта в массы, так сказать (а RedHat это делает).
systemd - активно не нравится из-за размера и прожорливости. Переход на него в debian заставил перейти на antiX, который без systemd. Но это частный случай, связанный с старым железом.
pulseaudio - может его микшер и удобен, но зачем поверх alsa еще и pulseaudio? Когда что-то не так, можно потеряться от количества возможных вариантов поиска и решения проблемы. В остальном - мне было достаточно alsa для моих нужд (а со звуком они скромные, так: лишь бы звук был, желательно раздельно на колонках и встроенных динамиках).