Самое трудное, хотя скорее непривычное, для новичка это переход на новую терминологию.
Скрипт, если я правильно понял, аналог исполняемого файла .bat? С более широкими, чем в том же DOSе или Win возможностями.
Copy. cd и т.д. ещё с 80-х помню. Список команд для Линукса есть. А никто не порекомендует, нормальную книгу по освоению? Не справочник, а учебник.