Т.е. никаких "интеллектуальных" скрытий как в xfce...
Их не будет - надо об окнах знать, слишком большая абстракция будет (чтоб от иксов и вейланда спасти). Можно унести автоскрытие в бэкенд, но блин, не хочу я чисто иксовой код писать.
В итоге одна панель вообще без апплетов в виртуалке запросто морозится если подержать мышку в ней
Ну а причем тут это? Не думаю, что это имеет отношение к алгоритму автоскрытия. Она должна скрываться через 200 мс после выхода. Или вы не выходите мышью с панели в виртуалке, а просто интеграцию мыши выключаете?
Тогда да, панель может заморозиться, она ж не получила leave-notify-event.
Тогда понятно, почему в верхней панели "перекрытие" иногда размораживало панель - мышка в нее попадала.
А разморозится она, если туда-сюда мышкой сделать, по идее.