4. в /mnt имею только ссылку .pupm-218-base.pfs -> /initrd/pup_ro2
Т.е. в /mnt отсутствуют sda1 и т.д., тогда надо создать виртуальный диск для начала или подключить существующий.
Putty - а что это за зверь
Ну, раз есть виртуальный диск PuppyRus.vdi, то сделай на него фругал установку и работая из нее сделай сохраненку, т.к. она может лежать только рядом с файлом pupm-218-base.pfs